Все рыбы р. Енисея по времени размножения подразделяются на весенненерестующих (щука, язь, елец, окунь, плотва и др.), летненерестующих (карась, линь, лещ, стерлядь и др.), осенненерестующих (ряпушка, сиг, омуль и др.) и зимненерестующих (налим). Одной из первых начинает нерест щука, сразу после распаления льда при температуре воды 5-7 °C, затем елец (6-7 °C), хариус (2-8 °C) и язь (6-8 °C). После того, как вода прогреется до 14 °C и выше, начинают метать икру осетр, стерлядь (14-15,5 °C), затем карась, лещ (16-18 °C). Для линя уже требуется вода, прогретая до 19-20 °C.

Сиговые рыбы начинают нерестовать осенью, в конце октября-ноябре, когда температура воды для ряпушки, омуля, муксуна не превышает 4 °C, для сига, пеляди - 6 °C, тугуна - 6-8 °C. Чир нерестует при температуре воды 1,2 °C. Зимой откладывает икру только налим. Его нерест проходит с конца декабря по март.